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其基本原理是蛋白质可以与末端标记的核酸探针结合。当电泳时，这种化合物比游泳凝胶中的无蛋白探针慢，这意味着它相对滞后。该方法可用于检测DNA结合蛋白、RNA结合蛋白、通过添加特异性抗体（supershift）检测特异性蛋白，并可鉴定未知蛋白。DNA向RNA的转录是基因表达的关键过程，基因表达的调控主要发生在转录水平。近年来，基因分子生物学领域的研究趋势之一正逐渐从对基因结构和功能的分析转向对顺式作用元件和转录因子及其转录调控机制的研究。基因转录调控的研究将是未来很长一段时间内功能基因组学研究的热点之一。EMSA的全称是电泳迁移率转移分析。中文称为凝胶迁移试验或电泳迁移试验。它是研究DNA与蛋白质或RNA与蛋白质相互作用的常用技术，可用于定性和定量分析。该技术基于DNA/蛋白质或RNA/蛋白质复合物在聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE）中具有不同迁移率的原理。首先，将蛋白质与末端标记的核酸探针结合，然后进行聚丙烯酰胺凝胶电泳。蛋白结合复合物的电泳速度比非蛋白结合探针慢。这样，page凝胶电泳结果就可以用来判断蛋白质是否与特定序列结合，或者序列是否与蛋白质结合。

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