数据分析基础 seq格式文件用什么软件打开?
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时间:2021-04-07 02:10:49
作者:admin
seq格式文件用什么软件打开?
.SEQ文件是DNA分析用的生物学软件的数据文件。打开.SEQ文件,可以使用DNASTARLasergene或Viewwithatexteditor软件打开。DNASTARLasergen是全面的生物医学软件,用作DNA和蛋白质序列分析、重叠群拼接和基因工程管理。包含了7个模块:SeqBuilder--可视化和序列编辑SeqManPro--序列集结和SNP发现MegAlign--序列组合PrimerSelect--oligoprimer设计Protean--蛋白质结构分析和预测GeneQuest--基因查找EditSeq--导入特殊文件工具
做完了转录因子的chip-seq后选择了感兴趣的靶基因,接下来还要做传统的chip qpcr验证吗?
转录因子的chip-seq不一定需要qpcr验证,但如果对转录因子进行敲除或knockdown,又不愿意做chip-seq,可对靶基因进行chip-qpcr。做western如果是转录因子,作用位置应该在核内,但有一些TF是细胞质易位到细胞核,所以看你关心的是总量还是什么,是否存在特殊修饰等等,根据需求选择。
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