探索Python求解Longest Common Subsequence(LCS)
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介绍LCS的定义及应用
最长公共子序列是指一个数列,如果它分别是两个或多个已知数列的子序列,并且在所有符合此条件的序列中属于最长的,那么就被称为已知序列的最长公共子序列。除了描述两个序列之间的相似性,LCS还可用于衡量两次修改前后的变化等,具有广泛的应用价值。
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获取打分矩阵的过程
首先需要获得一个打分矩阵,通过动态规划的编程思想,比较两序列的字符,确定打分矩阵中每个元素的数值。初始化矩阵c[i,0]0和c[0,j]0,计算当两字符相同时c[i,j]c[i-1,j-1] 1,否则为c[i-1,j]和c[i,j-1]的最大值。
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生成方向矩阵与算法实现
在计算打分矩阵的同时,需要生成方向矩阵用于回溯。以下是Python代码示例:
```python
def LCS(x, y):
import numpy as np
c ((len(x) 1, len(y) 1))
b ((len(x) 1, len(y) 1))
for i in range(1, len(x) 1):
for j in range(1, len(y) 1):
if x[i-1] y[j-1]:
c[i,j] c[i-1,j-1] 1
b[i,j] 2
else:
if c[i-1,j] > c[i,j-1]:
c[i,j] c[i-1,j]
b[i,j] 1
else:
c[i,j] c[i,j-1]
b[i,j] 3
return c, b
```
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构建回溯方法与输出结果
接下来需要构建回溯方法,根据方向矩阵的数值进行回溯,直至结束并输出结果。以下是实现回溯的Python代码:
```python
def getLCS(x, y):
c, b LCS(x, y)
i len(x)
j len(y)
lcs ''
while i > 0 and j > 0:
if b[i,j] 2:
lcs x[i-1] lcs
i - 1
j - 1
if b[i,j] 1:
i - 1
if b[i,j] 3:
j - 1
if b[i,j] 0:
break
return lcs
```
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算法实现的伪代码
以上是Python实现LCS算法的具体步骤和代码示例,其中包括获取打分矩阵、生成方向矩阵、构建回溯方法以及最终输出结果的过程。通过这些步骤,可以高效地求解最长公共子序列问题,为实际应用提供了有效的解决方案。
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