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如何高效地使用药物靶点预测系统

浏览量:1820 时间:2024-02-05 17:15:09 作者:采采

1. 账号登录

在使用药物靶点预测系统之前,首先需要登录你的账号。输入系统的网址,然后填写账号、组织号和密码即可成功登录。

2. 创建任务

登录系统后,点击创建按钮,会弹出一个任务创建框。任务创建包括绘制/导入结构、选择预测方法、相似值和活性分子库等参数。

3. 选择参数-绘制/导入结构

在任务创建框中,右边窗口可以选择绘制或者导入本地结构。你可以通过点击“添加”按钮,在系统内嵌的结构编辑器ipmDraw中绘制结构。也可以点击“导入”按钮,添加本地的结构文件(mol/sdf格式)。

4. 选择参数-选择预测方法及相似值

添加完结构后,根据你的需求选择合适的预测方法和相似值。系统提供了二维和三维相似度算法。当选择二维相似度时,建议将相似值设置为70%;选择三维相似度时,相似值设置为60%较为合适。

5. 选择参数-选择活性分子库

根据你的需求选择合适的活性分子库。系统提供了两类分子库,一种是已上市的药物库,包含约2600多个已上市的药物;另一种是配体库,包含公开发布的活性小分子集(包括文献、专利等),约七十万多个。如果想得到更多的预测结果,建议选择配体库。

通过以上傻瓜式操作和注意事项,你可以高效地使用药物靶点预测系统。希望这些简单的步骤能够帮助你顺利获得预测结果。请记住,正确选择参数和合理设置相似值是得到准确预测结果的关键。

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