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解决PBS脚本运行bash报错的方法

浏览量:1137 时间:2024-02-04 11:03:34 作者:采采

在最近几天,我们的服务器进行了一次对bash漏洞的更新,将bash版本升级到了4.1.2。然而,在用户通过PBS提交作业时,我们遇到了一个bash报错的问题。具体的错误信息如下:

-bash: BASH_FUNC_module(): line 0: syntax error near unexpected token `)'

-bash: BASH_FUNC_module(): line 0: `BASH_FUNC_module() () { eval `/usr/bin/modulecmd bash $*`}'

-bash: error importing function definition for `BASH_FUNC_module'

不同的机器可能会有不同的报错信息,但出现这种情况的原因是因为针对ShellShock漏洞的BASH补丁在定义输出函数的语法上与以前有所不同。正常情况下,我们定义一个函数并输出,之前的方式是这样的:

```shell

function_name() {

output

}

```

然而,由于更新后的BASH补丁,输出函数的定义方式发生了变化,变成了这样:

```shell

function_name() () {

output

}

```

这两种方式并不兼容,导致了我们遇到的错误。

针对这个问题,我们可以采取一种通用的解决方法,即在作业脚本的最前面加上以下一行代码:

```shell

source

```

这样,我们就重新载入了模块初始化脚本,避免了刚刚报错的错误。这种方法适用于大多数PBS脚本的情况。

值得一提的是,在解决这个问题时,我们需要确保系统中已经安装了``文件,该文件通常位于`/etc/profile.d/`目录下。如果系统中没有该文件,我们可以尝试使用以下命令安装:

```shell

sudo apt-get install environment-modules

```

另外,我们还可以检查一下是否有其他与模块相关的环境变量发生了变化,比如`MODULESHOME`和`MODULEPATH`等。这些环境变量的路径应该正确指向模块所在的位置。

综上所述,通过在PBS脚本中重新载入模块初始化脚本,我们可以解决由于bash更新导致的报错问题。这样,我们的PBS作业就能正常运行了。

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