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Python统计字符串子串重复次数

浏览量:2365 时间:2024-01-23 23:33:29 作者:采采

字符串子串重复次数是在字符串统计与处理中的一项基础操作。在DNA序列的分析中,这是一个非常常见的操作,因为重复序列在基因组中出现的频率很高。

遍历字符串所有子串并存入字典

首先,我们可以使用遍历的方法来统计字符串中子串的重复次数。我们将每一个子串存放在一个字典中,如果字典中已经存在该子串,则将对应的值加一;否则,将该子串添加到字典中,并将其值设为1。

dic  {} 
s  'AAAA' 
for i in range(len(s)): 
    for j in range(i 2, len(s)): 
        t  s[i:j] 
        if t in dic: 
            dic[t]   1 
        else: 
            dic[t]  1

我们将这种方法称为“蠕虫”,因为它类似于蠕虫在运动时无重复统计的特点。该方法可以获取字符串中所有字符,并统计它们在字符串中出现的次数。

升级版方法引入查询避免不必要的统计

为了提高效率,我们可以对上述方法进行改进。在比较之前,先引入查询,避免不必要的统计。具体操作是,在遍历字符串时,如果当前子串已经在字典中存在,则跳过该子串继续遍历;否则,进行统计。

def worm(s): 
    dic  {} 
    for i in range(len(s)-3): 
        j  i 
        s1  s[i:i 2] 
        if s1 in dic: 
            continue 
        s2  s[i 2:] 
        while (s1) ! -1: 
            count  1 
            stemp  s2 
            while (s1) ! -1: 
                count   1 
                stemp  stemp[(s1)   len(s1):] 
            if not (s1 in dic): 
                dic[s1]  count 
            j  1 
            s1  s[i:j 2] 
            s2  s[j 2:] 
    return dic

这个方法是对前一种方法的升级版,引入了查询操作,避免了不必要的统计。通过提高效率,我们可以更快地获得重复子串的统计结果。

总结

希望生物信息工作者能够相互交流,并提出修改建议,以进一步完善这些统计方法。

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