Python统计字符串子串重复次数
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时间:2024-01-23 23:33:29
作者:采采
字符串子串重复次数是在字符串统计与处理中的一项基础操作。在DNA序列的分析中,这是一个非常常见的操作,因为重复序列在基因组中出现的频率很高。
遍历字符串所有子串并存入字典
首先,我们可以使用遍历的方法来统计字符串中子串的重复次数。我们将每一个子串存放在一个字典中,如果字典中已经存在该子串,则将对应的值加一;否则,将该子串添加到字典中,并将其值设为1。
dic {}
s 'AAAA'
for i in range(len(s)):
for j in range(i 2, len(s)):
t s[i:j]
if t in dic:
dic[t] 1
else:
dic[t] 1
我们将这种方法称为“蠕虫”,因为它类似于蠕虫在运动时无重复统计的特点。该方法可以获取字符串中所有字符,并统计它们在字符串中出现的次数。
升级版方法引入查询避免不必要的统计
为了提高效率,我们可以对上述方法进行改进。在比较之前,先引入查询,避免不必要的统计。具体操作是,在遍历字符串时,如果当前子串已经在字典中存在,则跳过该子串继续遍历;否则,进行统计。
def worm(s):
dic {}
for i in range(len(s)-3):
j i
s1 s[i:i 2]
if s1 in dic:
continue
s2 s[i 2:]
while (s1) ! -1:
count 1
stemp s2
while (s1) ! -1:
count 1
stemp stemp[(s1) len(s1):]
if not (s1 in dic):
dic[s1] count
j 1
s1 s[i:j 2]
s2 s[j 2:]
return dic
这个方法是对前一种方法的升级版,引入了查询操作,避免了不必要的统计。通过提高效率,我们可以更快地获得重复子串的统计结果。
总结
希望生物信息工作者能够相互交流,并提出修改建议,以进一步完善这些统计方法。
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