引物怎么自己设计呢 caps标记和indel标记的区别？

caps标记和indel标记的区别？

Indel（插入-缺失）标记是指整个基因组中两个亲本之间的差异。与另一个亲本相比，一个亲本在基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失（Jander等人，2002）。根据基因组中的插入和缺失位点，设计了一些PCR引物对这些插入和缺失位点进行扩增，这些位点是InDel标记。Caps标记：SNP-PCR技术与RFLP技术相结合的分子标记技术。简单的理解是SNP仅仅位于酶消化的位点。通过设计SNP位点的引物，将PCR得到的相应产物片段经酶切、电泳等步骤进行消化，最后通过观察不同条带来判断样品的多态性。/Source network

在PubMed网站上找到相应的基因mRNA序列，复制到引物设计软件（如primer）软件会设计不同的正负链引物，选择合适的一个（得分较高），复制到PubMed网站，下拉列表中有一个PubMed blast。粘贴软件设计的前后引物，通过搜索结果判断引物是否正确、特异。

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