本地blast使用教程 如何使用ncbi核苷酸blast?
如何使用ncbi核苷酸blast?选择要比较的蛋白质序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中输入。如果要与数据库中的所有蛋白质序列进行比较,请从下面的“选择”搜索集中选择
如何使用ncbi核苷酸blast?
选择要比较的蛋白质序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中输入。如果要与数据库中的所有蛋白质序列进行比较,请从下面的“选择”搜索集中选择要比较的数据库。程序选择中的对齐方式可根据个人需要进行选择。如果执行成对对齐或多个序列对齐,请在“输入查询序列”框中选择“对齐两个或多个序列”,在弹出框中输入要对齐的序列,然后单击“blast”。结果分数越高,同源性越高,e值为期望值,分数越低,同源性越高
登录NCBI主页,点击blast,再点击核苷blast,将您的测序序列粘贴在弹出的网页上输入查询序列。在“选择搜索”集中,选择“其他”。别担心其他的。只需单击最后一次爆炸。
然后比较结果,稍后会弹出。因此,你可以理解它。没有解释。
可否介绍一下ncbi中blast的用法,详细点?
应该很有用。我不确定我所说的是否准确。Blast是NCBI中序列搜索或对齐的功能。通过序列的爆破,我们可以发现我们的扩增片段与测序片段的一致性,从而推断出我们扩增片段的具体功能。通过序列比对,我们还可以找到扩增片段的源生物体与其他生物体之间的遗传关系
引物爆炸,在线设计特异性寡核苷酸引物进行聚合酶链反应(PCR)。该工具集成了当前流行的primer3和NCBI-blast,用于引物特异性验证。底漆喷砂避免了使用其他站点或工具设计底漆的步骤,设计的底漆程序直接与喷砂一起导入