保守序列是什么意思 设计引物的时候，我比对氨基酸序列，由于保守性很高，老师让我用核苷酸序列比对？

设计引物的时候，我比对氨基酸序列，由于保守性很高，老师让我用核苷酸序列比对？

我们需要设计退化引物，对吗？

最好使用CDs序列进行比对，然后根据保守区域设计简并引物。CDs两端的非翻译区在种间差异较大，不适合设计引物。

从每个物种获得的CD应制作成FASTA格式，序列应制作成纯序列格式，没有任何其他字符。与DNI、vector或其他工具（如atmen）进行比较。

我们可以通过在比较结果中找到非常保守的区域来设计简并引物。

设计的简并引物可根据经验公式自行计算TM值。别担心得分。因为你只能在保守地区设计引物。

这是DNA序列比对。有保守区和非保守区。在我看来，底漆的3“端应该位于最保守的区域。

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