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blast什么意思啊 如何使用ncbi核苷酸blast?

浏览量:1706 时间:2021-03-27 20:36:59 作者:admin

如何使用ncbi核苷酸blast?

选择要比较的蛋白质序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中输入。如果要与数据库中的所有蛋白质序列进行比较,请从下面的“选择”搜索集中选择要比较的数据库。程序选择中的对齐方式可根据个人需要进行选择。如果执行成对对齐或多个序列对齐,请在“输入查询序列”框中选择“对齐两个或多个序列”,在弹出框中输入要对齐的序列,然后单击“blast”。结果得分越高,同源性越高。E值是期望值。分数越低,同源性越高

blast(basic local alignment search tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。Blast程序可以快速地将相似序列与公共数据库进行比较。blast结果中的分数是相似性的统计解释。

NCBI有很多种,包括n-blast(核苷酸序列比对搜索)和p-blast(蛋白质比对搜索)。此外,还有底漆喷砂等。

Blast比较一个或多个核酸或蛋白质序列库中的一个或多个序列(可以是任何形式的序列)。Blast还可以找到具有可以对齐的间隙的序列。Blast可以处理任意数量的序列,包括蛋白质序列和会计序列。它也可以选择多个数据库,但数据库必须是同一类型的,即蛋白质数据库或核酸数据库。查询序列和数据库可以是任意组合,要么核酸序列到蛋白质库进行查询,要么蛋白质序列到蛋白质库进行查询,反之亦然。

blast什么意思?

Blast是英语中贝尔实验室分层时空的缩写。它是一种利用多天线系统和多径传播效应来提高频谱利用率的新型通信技术。目前,blast技术与OFDM(正交频分复用)和自适应编码技术一起被公认为3G(超越IMT2000)和4G时代的三大关键空中接口技术。

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