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首先,序列的FASTA格式保存在进化树的TXT文本中,然后打开Meggie 3.1。alignment Explorer/Clustal create a new alignment OK no for protein插入文件夹框的右上角。否是将数据保存到mega是在mega中打开数据关闭系统发育邻居连接树的第二或第三间隔分支测试图像另存为EMF格式
mega的全称是分子进化遗传学分析。Mega可以用于序列比对、进化树的推断、分子进化速度的估计、进化假设的验证等,还可以通过网络(NCBI)进行序列比对和数据搜索。打开并选择alignment—alignment Explorer/cluster,弹出对话框:按提示选择。在这里,我将选择第一个“创建新路线”。这里我将根据我的序列是核酸还是氨基酸来选择。在这里我将选择“是”,对话框将出现:日期打开检索序列从文件,选择对齐格式文件[Clustal file(。AlN)]在cluster X中:选中后,可以双击文件名进行修改(如果cluster X的某个版本不能识别原来的FASTA文件名,可以在这里进行修改,就像cluster X 1.81的中文版本不能识别某些序列文件名一样)。修改完文件名后,可以在右键菜单中单击〖删除簇〗按钮,保存“当前比较结果”供下次使用。然后,我将添加clusterx程序是集成的。在“对齐”菜单中,选择“按簇X对齐”。选择要对齐的序列,然后单击以打开以下对话框:选择默认设置,然后单击“确定”以执行对齐。之后,将出现一个转换对话框,显示两两对齐和多序列对齐的过程:等待它运行后,您可以直接保存或删除它。对话框将出现:选择是,它将出现:输入一个名称,如siv-n2,接下来的几个步骤是类似的。保存后,单击〖是〗按钮,系统显示:当序列数据界面出现时,注意的主界面发生了一定的变化,多了几个功能菜单:在主界面中选择系统发育菜单,系统发育的bootstrap检验选择相邻连接1000个重复序列作为bootstrap,选择核酸p距离作为模型。经过计算,我们得到了系统结构树,如下图:由kousyouki
Mega进化树如何改变生物的学名
转到PPT,取消组合,然后它会变成一个单位框,你可以修改字体。
修改后,将它们组合在一起并以TIF格式保存。决议应该是可以的。
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