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luminati使用教程 怎么利用bioedit把两段有重复的序列拼接?

浏览量:2481 时间:2021-03-21 11:59:52 作者:admin

怎么利用bioedit把两段有重复的序列拼接?

达曼或奥芬德可以做到。Bioedit方法:文件→打开你的核酸序列文件→点击菜单中的序列→点击下拉菜单中的核酸→翻译→选择合适的帧得到结果。

用bioedit怎么导出想要的序列?

首先,将所有序列复制到windows的记事本中,以FASTA格式保存在同一个文件中,并将其另存为*。文本。最好不要在序列中有空格或新行。序列格式的示例如下:“>序列1ATCG.ATCG>序列2ATCG.ATCG>序列3ATCG.ATCG>顺序4ATCG.ATCG公司然后,使用bioedit打开文件*。刚才保存的TXT,单击窗口顶部的附件应用程序菜单,然后单击clusterwmultiple alignment。这时会弹出一个窗口,直接选择runclustalw,然后弹出一个窗口,选择OK,等待结果出来。最后的比较结果可以保存在*。Fas格式,适用于各种分析。

如何使用bioedit翻译核算序列?

Dnaman或ORF finder可以做到这一点。

Bioedit方法:文件→打开核酸序列文件→单击菜单中的序列→单击下拉菜单中的核酸→翻译→选择适当的帧以获得结果。

怎样用bioedit构建序列相似性矩阵?

要解决大规模数据集上的所有成对相似性搜索(或成对相似性),或挖掘最相似的Top-k项(k-最近邻图构造,或TOPK集扩展),主要有以下方法(以文档相似性为例)。

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