lammps安装教程windows10 安装lammps前需要安装fftw和mpich吗?
安装lammps前需要安装fftw和mpich吗?
必须记住安装路径。编译lammps时,需要修改makefile。G文件。您需要使用fftw和MPICH的路径。另外,系统还需要安装g,或者直接安装build sential。fftw最好使用2-1.5版本,MPICH最好使用2-1.5版本。建议不要在笔记本电脑上运行lammps,这样会对笔记本电脑造成很大伤害。用笔记本电脑测试是可行的。一般来说,lammps的计算量很大,需要数百万步。用一个CPU计算太慢,所以lammps通常是并行版本,这意味着可以使用多个CPU同时执行相同的计算。当有计算任务时,先用脚本测试脚本是否可以运行,用VMD检查模型是否符合您的要求,如果没有问题,再带到桌面上运行。fftw的安装路径可以自己选择,但如果不在主文件夹中,则需要作为根目录安装。如果安装过程中没有错误,则安装成功。
lammps该怎么入门?
我忘了我在研究生毕业后用过lammps。现在我已经工作十年了。我一直在研究所从事结构动力学实验。我差点忘了。我不敢相信,当我读到我的论文和之前的几十个G文献和计算数据时,我自己也这么做了。
这里我只能提供一个想法。我真的忘了细节。首先,在使用lammps时,我们需要熟悉分子动力学。我们是一名两年半的研究生。在我大四的第一年,我从事有限元计算。第二年,我花了将近一年的时间阅读分子动力学相关的文献,但我什么也没做。第三年,我开始计算和写论文,半年就完成了。我觉得虽然硕士课程很浅,但我的基础还是比较扎实的。
在大学里,我喜欢扔Linux发行版。笔记本已格式化n次。实际上,学习Linux的过程已经省略了,所以我可以直接编译lammps。
程序从官方网站下载最新版本,势函数记不清在哪里找,基本根据文献,还试着自己写势函数,结合atom和VMD可视化,用MATLAB分析,源代码绘图,基本够用。
学习路径基本上是由易到难,先做最简单的例子,然后需要在文献中重现结果,根据自己的题目选择合适的势函数,需要做大量的验证,包括材料参数的计算,结晶过程的计算等。当然,我们必须根据计算机的计算能力来确定计算规模。
如果不懂,可以查文献,查文献,查文献。一开始我也在小木虫论坛,里面有很多神。总之,如果你试着多做些例子,你就可以开始了。
现在我基本上是外行了。如果我说错了什么,我会原谅你的。目前,还可以讨论结构动力试验的相关问题。
lammps中怎么固定一族原子?
您可以使用dump命令,添加FX、FY和FZ。这三项是力在三个方向上对每个原子的分量。例如:dump 2 subgroup custom 1000转储.atomID FX FY FZ lammps将每1000个时间步改变称为“子群”的群中所有原子的序列号和三个方向上的应力
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