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pcr为什么要两种引物 巢式PCR中的引物怎么设计?

浏览量:4979 时间:2021-03-19 04:45:10 作者:admin

巢式PCR是一种变异的聚合酶链反应(PCR),其中两对PCR引物用于扩增一个完整的片段。第一对引物的扩增片段与普通PCR相似。第二对引物称为套式引物(因为它们在第一次PCR扩增中),并与第一次PCR产物结合,使第二次PCR扩增比第一次短。巢式PCR的优点是,如果在第一次扩增中产生了错误的片段,那么在第二次扩增中对错误片段进行引物配对和扩增的概率很低。因此,巢式PCR扩增具有很强的特异性。

巢式PCR中的引物怎么设计?

巢式PCR一般有两对引物,一对外引物和一对内引物。为方便起见,一般建议内引物直接根据靶序列设计引物(与普通PCR引物设计方法相同),外引物根据靶序列两端的序列设计引物,即上下游来回移动一些碱基来设计引物。内外引物的设计应包含重叠区,一般为10bp。如果手头只有目标序列,而且目标序列前后没有序列信息,可以用普通引物作为外引物,然后从序列内部设计一对内引物。原理与以前相同,也应该包含10个左右的碱基重叠区。这时,因为你的内引物PCR产物会少碱基序列,你可以设计第三对引物,这对引物是外引物和内引物的剪接序列,然后PCR,缺失的碱基会被人为添加。

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