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构建进化树里内群外群怎么弄？

系统发育树通常有无根树和有根树。如果一棵有根的树被建造，则需要外类群。所谓外类群是与你所研究的序列密切相关的序列，外类群可以很好地聚集成一个分支（如果外类群中有多个序列）。如果研究进化史，应选择进化史早于目标序列的序列作为外类群。

建议您看一看这本书：分子进化和系统发育学，其中详细介绍了这方面的内容。

一般来说，没有严格的区分标准。

细菌16S rDNA序列分析以后，怎么构建进化树？

下载软件或在线构建软件的方法很多。在线构建可以将您的序列输入PubMed blast n进行比较。其中一个结果是系统发育树，但有太多的序列留在它的比较。按相反顺序选择。有很多软件，最简单的是DNAStar中的megalin，但结果很粗糙。建议使用clustalx软件进行同源性比较，然后使用mega3.0软件进行系统发育分析，绘制系统发育树。这也是非常简单和容易看到的解释。Philip系列软件被普遍认为是严谨的，但其操作是复杂的。

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