gsea图怎么看 GSEA分析是个什么鬼?
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时间:2021-03-15 04:46:50
作者:admin
GSEA分析是个什么鬼?
GSEA,基因探针富集分析,是基于评估来自微阵列的数据的各级别基因探针。 GSEA的初始版本是用来分析糖尿病人与正常人的肌肉活组织采样数据。分析显示,有某些基因牵涉到糖尿病人的氧化磷酸化作用的减弱,而其他独立的微阵列研究和活体功能研究中也证实了这个结果。 GSEA的使用方法是,使用者利用在权威刊物上发表过的相关生物学通路和实验得来的共表达数据,把基因探针分门别类,并根据相关性通过一系列运算,得出探针集是否能在表型上揭示出相关基因组的分布方式。
只有genelist怎样做gsea分析实验?
您好,我来为您解答:
只有gene list的话,只能尝试其他Functional Classification/enrichment方法,比如DAVID及基于GO的TANGO,BiNGO,GoMiner GOstat等。
希望我的回答对你有帮助。
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