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怎么使用blast查基因 如何使用ncbi核苷酸blast?

浏览量:1783 时间:2021-03-11 18:55:32 作者:admin

如何使用ncbi核苷酸blast?

选择要比较的蛋白质序列,在blast界面的enterquerysequence下的大框中输入。如果要与数据库中的所有蛋白质序列进行比较,请从下面的“选择”搜索集中选择要比较的数据库。程序选择中的对齐方式可根据个人需要进行选择。如果执行成对对齐或多个序列对齐,请在“输入查询序列”框中选择“对齐两个或多个序列”,在弹出框中输入要对齐的序列,然后单击“blast”。结果得分越高,同源性越高。E值是期望值。分数越低,同源性越高

应该有用。不清楚我所说的是否准确。Blast是NCBI中序列搜索或对齐的功能。通过序列的爆破,我们可以发现我们的扩增片段与测序片段的一致性,从而推断出我们扩增片段的具体功能。通过序列比对,我们还可以找到扩增片段的源生物体与其他生物体之间的遗传关系

引物爆炸,在线设计特异性寡核苷酸引物进行聚合酶链反应(PCR)。该工具集成了当前流行的primer3和NCBI-blast,用于引物特异性验证。底漆喷砂避免了使用其他站点或工具设计底漆的步骤。设计的引物程序直接使用blast来选择需要比较的蛋白质序列。在blast界面的Enter query sequence下的大框中输入。如果要与数据库中的所有蛋白质序列进行比较,请在下面的“选择搜索集”中选择需要比较的数据库。程序选择中的对齐方式可根据个人需要进行选择。如果执行成对对齐或多个序列对齐,请在“输入查询序列”框中选择“再对齐两个序列”,在弹出框中输入要对齐的序列,然后单击“blast”。结果得分越高,同源性越高。E值为期望值,分值越低,同源性越高

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